Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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