Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
J3QKU1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QKU1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QKU1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QKU1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QKU1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QKU1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QKU1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QKU1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QKU1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QKU1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QKU1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QKU1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QKU1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QKU1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QKU1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QKU1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QKU1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms