Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms