Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF28PB7ZC32 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIF28PB7ZC32 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms