Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B4DEV8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DEV8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DEV8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DEV8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms