Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTAGE9A4FU28 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTAGE9A4FU28 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTAGE9A4FU28 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTAGE9A4FU28 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE9A4FU28 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE9A4FU28 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms