Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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