Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP15Q9Y4E8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms