Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRELID3BQ9Y3B1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRELID3BQ9Y3B1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRELID3BQ9Y3B1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms