Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG5Q9UPR3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMG5Q9UPR3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms