Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4EQ9ULY5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLEC4EQ9ULY5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms