Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN2Q9ULH4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN2Q9ULH4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms