Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
NRXN1Q9ULB1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRXN1Q9ULB1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms