Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA4Q9UI42 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms