Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DBF4Q9UBU7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DBF4Q9UBU7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms