Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL20A1Q9P218 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
COL20A1Q9P218 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms