Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABRACLQ9P1F3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABRACLQ9P1F3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms