Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ0

DNAJC27, DnaJ homolog subfamily C member 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC27Q9NZQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC27Q9NZQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAJC27Q9NZQ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms