Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXL2Q9NZ53 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.4 ms