Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRN3Q9NYV6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms