Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD3Q9NYL9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms