Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 HK1-204ENST00000421088 707 ntTSL 59.04□□□□□ -0.966e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.986e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.196e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 HK1-214ENST00000483077 750 ntTSL 36.9□□□□□ -1.36e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.366e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 HK1-210ENST00000476368 605 ntTSL 36.4□□□□□ -1.386e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.436e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.496e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 HK1-207ENST00000450646 739 ntTSL 55.72□□□□□ -1.496e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PPIG-206ENST00000433207 1485 ntTSL 1 (best)5.53□□□□□ -1.526e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 HK1-208ENST00000464803 450 ntTSL 1 (best)3.89□□□□□ -1.796e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.816e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 DENND4A-207ENST00000567323 804 ntTSL 23.67□□□□□ -1.826e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.956e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.186e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.879e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 ESRRA-205ENST00000468670 742 ntTSL 224.94■■□□□ 1.589e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 CXXC1-204ENST00000586365 789 ntTSL 224.3■■□□□ 1.489e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.429e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 CXXC1-210ENST00000587396 476 ntTSL 222.22■■□□□ 1.159e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-213ENST00000552347 1645 ntTSL 521.56■■□□□ 1.049e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 THUMPD3-AS1-209ENST00000518437 240 ntTSL 221.41■■□□□ 1.029e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.989e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.989e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.989e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.839e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-212ENST00000551749 2091 ntTSL 219.96■□□□□ 0.799e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-206ENST00000549370 628 ntTSL 519.6■□□□□ 0.739e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.449e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.399e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-204ENST00000547897 440 ntTSL 516.77■□□□□ 0.289e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.159e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-215ENST00000552705 1081 ntTSL 215.88■□□□□ 0.139e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.119e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-210ENST00000550671 764 ntTSL 215.62■□□□□ 0.099e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-216ENST00000552851 691 ntTSL 515.09■□□□□ 0.019e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.169e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 314□□□□□ -0.179e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPL18-203ENST00000547892 3844 nt13.78□□□□□ -0.29e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RNA5SP370-201ENST00000362545 121 ntBASIC13.45□□□□□ -0.263e-12■■□□□ 13
AATFQ9NY61 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.39e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.699e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.729e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.769e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.799e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.59e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 THUMPD3-AS1-204ENST00000480904 493 ntTSL 35.64□□□□□ -1.519e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 THUMPD3-AS1-218ENST00000522525 1867 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.559e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.619e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 34.82□□□□□ -1.649e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 THUMPD3-AS1-201ENST00000467069 667 ntTSL 54.51□□□□□ -1.699e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 54.49□□□□□ -1.699e-7■■□□□ 13
AATFQ9NY61 SERTAD2-202ENST00000476805 1068 ntTSL 324.78■■□□□ 1.565e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.15e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 221.3■■□□□ 17e-11■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PTBP2-204ENST00000459735 791 ntTSL 510.94□□□□□ -0.667e-11■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.777e-11■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.777e-11■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PTBP2-207ENST00000476419 1691 ntTSL 1 (best)10.25□□□□□ -0.777e-11■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.987e-11■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PTBP2-208ENST00000476783 779 ntTSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.357e-11■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PTBP2-210ENST00000492905 776 ntTSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.357e-11■■□□□ 13
AATFQ9NY61 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.797e-11■■□□□ 13
AATFQ9NY61 TXNRD2-217ENST00000496729 910 ntTSL 424.17■■□□□ 1.462e-23■■□□□ 13
AATFQ9NY61 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 214.44□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 13
AATFQ9NY61 RPSA-207ENST00000478027 1227 ntTSL 214□□□□□ -0.172e-16■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 213.83□□□□□ -0.22e-16■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.42e-16■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.942e-16■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.075e-8■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.745e-8■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.645e-8■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.595e-8■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.575e-8■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.075e-8■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.945e-8■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 SEMA4C-206ENST00000482925 3776 ntTSL 215.05■□□□□ 04e-6■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.59■■□□□ 1.853e-41■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 TUBB4B-202ENST00000604929 2035 ntTSL 1 (best)22.71■■□□□ 1.239e-8■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.449e-8■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.244e-10■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.194e-10■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.124e-10■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.124e-10■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.814e-10■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.544e-10■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 ATG16L1-208ENST00000419681 644 ntTSL 519.8■□□□□ 0.763e-66■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 ATG16L1-217ENST00000492298 591 ntTSL 513.05□□□□□ -0.323e-66■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.9□□□□□ -1.143e-66■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 522.09■■□□□ 1.135e-7■■□□□ 12.9
AATFQ9NY61 UBE2G2-205ENST00000478200 637 ntTSL 425.67■■□□□ 1.77e-7■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 UBE2G2-212ENST00000497664 590 ntTSL 425.67■■□□□ 1.77e-7■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 UBE2G2-209ENST00000491513 744 ntTSL 423.79■■□□□ 1.47e-7■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 UBE2G2-211ENST00000497630 933 ntTSL 223.5■■□□□ 1.357e-7■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 UBE2G2-204ENST00000477954 1034 ntTSL 319.54■□□□□ 0.727e-7■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.497e-7■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.227e-7■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 UBE2G2-206ENST00000481546 4340 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.847e-7■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.944e-7■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 AL034397.3-201ENST00000618234 1690 ntTSL 1 (best)8.69□□□□□ -1.024e-7■■□□□ 12.8
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