Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC25Q9NXE8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms