Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDL2Q9NX52 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDL2Q9NX52 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms