Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM160Q9NX00 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM160Q9NX00 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms