Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms