Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNAJC17Q9NVM6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms