Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AP5S1Q9NUS5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms