Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CNNM1Q9NRU3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms