Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAPOLBQ9NRJ5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAPOLBQ9NRJ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAPOLBQ9NRJ5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAPOLBQ9NRJ5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms