Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCL28Q9NRJ3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCL28Q9NRJ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms