Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL3Q9NQ33 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms