Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCFQ9NPI8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCFQ9NPI8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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