Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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