Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCL3Q9H2J4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCL3Q9H2J4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms