Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.361e-11■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.486e-10■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.56e-10■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 ARL6IP6-205ENST00000495469 1308 ntTSL 219.7■□□□□ 0.746e-9■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.086e-9■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.841e-6■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 CRIP2-210ENST00000551836 627 ntTSL 322.74■■□□□ 1.231e-6■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 CRIP2-211ENST00000552643 1383 ntTSL 222.72■■□□□ 1.231e-6■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 CRIP2-204ENST00000547643 1373 ntTSL 321.05■□□□□ 0.961e-6■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 CRIP2-203ENST00000538259 991 ntTSL 218.1■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 CRIP2-208ENST00000550577 817 ntTSL 210.7□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.286e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.778e-8■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.418e-8■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.318e-8■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 LONP1-211ENST00000590558 2884 ntTSL 515.65■□□□□ 0.18e-8■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 LONP1-206ENST00000587552 2816 ntTSL 214.48□□□□□ -0.098e-8■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.128e-8■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.148e-8■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 LONP1-209ENST00000590206 725 ntTSL 311.6□□□□□ -0.558e-8■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 GATD1-210ENST00000529362 578 ntTSL 321.88■■□□□ 1.095e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 BRD9-203ENST00000475706 744 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.673e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 PDXK-213ENST00000472777 460 ntTSL 510.99□□□□□ -0.653e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.55e-13■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.845e-13■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.955e-13■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 KIF13A-208ENST00000503342 738 ntTSL 39.1□□□□□ -0.955e-13■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.985e-13■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.275e-13■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 KIF13A-202ENST00000358380 4200 ntTSL 1 (best)6.98□□□□□ -1.295e-13■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.296e-8■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 16e-8■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 SH3YL1-213ENST00000463865 1999 ntTSL 517.42■□□□□ 0.381e-9■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 NRDE2-203ENST00000554464 612 ntTSL 316.37■□□□□ 0.213e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.133e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.263e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 AC025165.3-203ENST00000546504 373 ntAPPRIS P1 TSL 213.22□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.563e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 AC025165.3-202ENST00000553083 332 ntTSL 211.11□□□□□ -0.633e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 NRDE2-202ENST00000553409 3434 ntTSL 1 (best)10.91□□□□□ -0.663e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 NRDE2-205ENST00000556189 2937 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.693e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.846e-8■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 RPLP1-201ENST00000260379 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.93e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.543e-7■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 MAD1L1-208ENST00000437877 864 ntTSL 214.1□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 23.2
CSTF2TQ9H0L4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.072e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.156e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.256e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.466e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 FHIT-204ENST00000468189 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.676e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 FHIT-206ENST00000488467 601 ntTSL 310.43□□□□□ -0.746e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 FHIT-207ENST00000490952 1720 ntTSL 1 (best)8.88□□□□□ -0.996e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 COL18A1-207ENST00000473212 2515 ntTSL 219.54■□□□□ 0.724e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 COL18A1-205ENST00000423214 839 ntTSL 515.35■□□□□ 0.054e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.293e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.33e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 218■□□□□ 0.472e-8■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.651e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.489e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 DBNDD1-205ENST00000568662 563 ntTSL 215.72■□□□□ 0.119e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.089e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.189e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.329e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 DBNDD1-204ENST00000568330 567 ntTSL 512.46□□□□□ -0.419e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 220.14■□□□□ 0.816e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 219.41■□□□□ 0.78e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 27.13□□□□□ -1.271e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 C15orf39-205ENST00000564848 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.16■□□□□ 0.981e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 C15orf39-203ENST00000562637 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.3■□□□□ 0.041e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 C15orf39-204ENST00000563905 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 414.27□□□□□ -0.131e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.671e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 TAF1D-205ENST00000526015 1735 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.263e-11■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 TAF1D-201ENST00000323981 2540 ntTSL 212.9□□□□□ -0.343e-11■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 TAF1D-219ENST00000534079 656 ntTSL 28.2□□□□□ -1.13e-11■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.755e-9■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 REV1-203ENST00000413697 4727 ntTSL 218.4■□□□□ 0.545e-9■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.35e-9■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 TBXAS1-215ENST00000474763 582 ntTSL 519.48■□□□□ 0.714e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 TBXAS1-217ENST00000481440 728 ntTSL 317.74■□□□□ 0.434e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.334e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.134e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 TBXAS1-219ENST00000493340 703 ntTSL 410.06□□□□□ -0.84e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 TBXAS1-211ENST00000462053 459 ntTSL 38.77□□□□□ -1.014e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 TBXAS1-214ENST00000473948 241 ntTSL 58.53□□□□□ -1.044e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 AATK-209ENST00000575363 475 ntTSL 314.46□□□□□ -0.096e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.557e-7■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 PTPN12-209ENST00000460731 582 ntTSL 25.68□□□□□ -1.54e-11■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 AC006504.5-209ENST00000591549 500 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 AC006504.5-206ENST00000585917 719 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.152e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.272e-6■■■■□ 23.1
CSTF2TQ9H0L4 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 23.1
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