Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms