Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms