Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPS2Q9BXY5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPS2Q9BXY5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms