Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3CQ9BXW4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms