Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IFT27Q9BW83 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFT27Q9BW83 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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