Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT61BQ9BVS5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT61BQ9BVS5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms