Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP8Q9BV40 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms