Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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C9orf16Q9BUW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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C9orf16Q9BUW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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C9orf16Q9BUW7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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C9orf16Q9BUW7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf16Q9BUW7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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