Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms