Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R9BQ96SB3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms