Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC2Q96RQ1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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