Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED4Q96RK1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED4Q96RK1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms