Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms