Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms